クリニック薬剤師の年収が高いって本当？　転職前に押さえたい魅力と注意点

今回は、病院薬剤師のなかでも、とくにクリニックで働く薬剤師の年収とキャリアにスポットを当てて解説します。 ひとくくりに「病院」としてしまいがちですが、実はクリニックと病院には明確な違いがあります。

ただ、クリニック勤務の薬剤師は人数が少ないこともあり、同じ薬剤師のなかでもその実態がなかなか見えにくくなっています。「クリニックと病院とは何が違うの？」「クリニックで働くと年収は低くなる？」など、改めて考えるとわからないことも多いのではないでしょうか。

最新データを見ると、クリニック勤務のイメージをくつがえす意外な事実が浮かび上がってきました。

高年収（年収600万円以上）
クリニック薬剤師への転職はこちら
（エムスリーキャリア）

確認

クリニック勤務薬剤師の平均年収はいくら？

まず気になるのはクリニックで働くと年収はどのくらいになるか、ではないでしょうか。ここからは、最新のデータを交えながら解説していきます。

クリニック勤務薬剤師の平均年収

クリニックは個人の経営であることも多く、経営状況や診療科目、また地域によって薬剤師や看護師などのスタッフの給与にはかなり幅があります。

ここで、厚生労働省が発表した「第25回 医療経済実態調査（令和7年実施）」を確認してみましょう。この調査によると、入院を扱っていない個人経営の一般診療所、つまりクリニックに勤務する常勤薬剤師の平均年収は、約609万円となっています。

出典：第25回 医療経済実態調査報告（令和7年実施）

病院勤務の薬剤師の平均年収

次に、入院を扱っている医療法人、つまりクリニックではない病院に勤務する薬剤師の年収を確認してみましょう。病院で働く薬剤師の平均年収は513万円となっています。

このふたつを比べてみると、クリニック勤務の薬剤師のほうが年収が高くなっています。病院よりも規模の小さい病院のほうが年収が高いことを不思議に思う人もいるのではないでしょうか。

実は、病院薬剤師の年収は、一般的に調剤薬局などに比べて低いと言われています。

この理由のひとつに、病院は新卒の薬剤師の就職先として人気があり、採用に困らないということがあります。とくに入院施設を備えた大学病院や総合病院では、その傾向が強くなります。新卒が多いということは、平均勤続年数も短いため、データ上の年収は低くなります。夜勤や当直があるため、結婚したり出産したりしたあとに長く続けるのは難しいということもあるかもしれません。

ほかの職場の薬剤師の平均年収との比較

では、次に、クリニックや病院以外の薬剤師の主な職場と比較してみましょう。
薬キャリエージェントの調査によると、薬剤師の職場別の平均年収は次のようになっています。

先ほどの調査と調査の時期や方法が違うので金額を単純には比べることはできませんが、一般的に、薬剤師の職場のなかではドラッグストアが最も年収が高く、次いで調剤薬局、病院という傾向があります。

高年収をめざすなら、病院やクリニックにこだわらず、ドラッグストアや調剤薬局で働くという選択肢もあります。

ほかの医療職との平均年収の比較

次に、先ほどの「第25回 医療経済実態調査（令和7年実施）」で、クリニック勤務のほかの医療職の年収についてみてみましょう。

同じ「入院を扱っていない個人経営の一般診療所」（クリニック）という条件の場合、医師の平均年収は約1100万円となっています。一方で、入院を扱う医療法人勤務の医師の平均年収は935万円です。自分で開業している個人経営の医師が高年収であることがわかります。

一方で、クリニック勤務の看護師の平均年収は約371万円、臨床検査技師や診療放射線技師などの医療技術員の平均年収は約418万円となっています。
こうして比較すると、薬剤師の給与はクリニック内では高水準であるといえるでしょう。

クリニック勤務薬剤師の年収の特徴

ここまでみてきたように、クリニックにおいては医師と薬剤師が高年収となっています。医師は自分が経営者であるので納得できますが、薬剤師も高年収なのは意外に感じられます。一般的には大病院のほうが高収入なイメージがありますが、なぜクリニック勤務の薬剤師の年収が高くなっているのでしょうか。

まず、クリニック勤務の薬剤師の特徴としてあげられるのが、管理薬剤師の割合の高さです。

小規模なクリニックでは薬剤師が1人だけだったり、常勤1人とパートだったりということが多く、必然的にその1人が管理薬剤師となります。管理薬剤師になると、責任が重くなる代わりに管理職手当もつくので、一般薬剤師に比べて大きく給与アップします。そのことが年収の底上げ要因となっています。

また、クリニックで働く薬剤師の特徴として、医師の家族や親族が薬剤師として働いているケースが多いことがあります。
院長が経営者で薬剤師が家族や親族の場合、節税の観点などから一般的な相場よりも薬剤師の給与が高く設定されることが多々あります。こうした身内への高報酬が統計上の平均値を押し上げている側面があるのです。

そのため、このデータだけを見てクリニック勤務だと給与が高いと判断するのは危険です。外部から一般採用される薬剤師の年収とはギャップがある可能性があることには注意しましょう。

それ以外にも、クリニックの場合は、院長の考えによって、給与だけでなく昇給のシステムや住宅手当や家族手当などの各種手当も決まります。
クリニックで働く場合には、このような特徴を理解しておくことが大切です。

時給2500円以上のクリニックも
薬剤師の転職はこちら
（エムスリーキャリア）

確認

クリニックと病院、そもそもの違いは？

一般的には「病院」とくくられてしまいますが、クリニックと病院では法律上の定義や業務の性質は大きく異なります。知っているようで知らない違いについて確認してみましょう。

クリニックとは

クリニックとは一般的に入院病床が19床以下、または入院設備を持たない医療機関を指し、「診療所」とも呼ばれます。それに対して、20人以上の入院施設があるのが「病院」となります。

クリニックは外来診療が中心となり、地域住民にとって最も身近な医療機関として機能しています。内科や皮膚科、整形外科など特定の診療科目に特化した施設が多く、患者さんが日常的に通院しやすいのがクリニックです。地域医療の入口として重要な存在だといえます。

薬の面からみると、国が進めてきた「医薬分業」の流れもあり、薬剤師が常駐して院内処方を行っているクリニックは減少傾向にあります。

クリニックと病院　業務内容の違い

次に、クリニックと病院で薬剤師の行う業務にはどのような違いがあるかを確認してみましょう。

入院を扱う病院の薬剤師は、外来患者への調剤や服薬指導のほかに、入院患者への服薬管理や注射調剤、病棟業務などを担当します。医師や看護師と連携してチーム医療の一員として専門的な役割を担うことが大きな特徴であり、やりがいが感じられるところです。

一方でクリニック勤務薬剤師の仕事は外来患者への調剤業務と服薬指導がメインとなります。薬剤師の数が少ないため、病院内の在庫管理や医療事務などを担当することもあります。
扱う薬の種類はそのクリニックの診療科目に特化するため、特定の分野に非常に詳しくなります。

クリニックと病院　勤務時間の違い

入院患者のいる病院では24時間体制の医療提供が必要なため、薬剤師もシフト制で、夜勤や当直、休日勤務があるところもあります。
これに対してクリニックは、診療時間に合わせた勤務が基本となります。

夜勤がなく、日曜祝日は休みなので、家族や友達とも比較的生活リズムを合わせやすいでしょう。
ただし、クリニック特有の「中抜き」があり、昼休憩が2〜3時間と長いため、拘束時間は意外と長い場合があります。

30代向けの求人、ご紹介できます
薬剤師の転職はこちら
（エムスリーキャリア）

確認

薬剤師がクリニックで働くメリット

ここからは、薬剤師がクリニックで働くメリットについてみていきます。同じ医療機関でもハードな大規模病院で働くことに疲れてしまった薬剤師にとって、思わぬ魅力があるかもしれません。

勤務時間が安定している

クリニック勤務の最大の魅力は勤務時間が安定していることです。診療時間に合わせた勤務になるため、夜勤や当直がなく、生活リズムを保ちやすいといえます。特に家庭やプライベートとの両立を重視する薬剤師にとって働きやすいといえるでしょう。
残業も比較的少ない職場が多く、休日出勤もないので、長く働き続けやすいといえます。

患者さんとの深いつながりが作りやすい

地域密着型の医療機関であるクリニックでは、同じ患者さんが継続して来院することが多く、長期的な関係を築きやすくなっています。
患者さんの生活背景や服薬状況を理解しながら関われるので、やりがいを感じることができる職場です。

調剤以外の医療事務や経営スキルが身につく

クリニックでは職員数が少ないため、調剤業務だけでなく、受付業務や在庫管理、レセプト関連業務などに広く関わる場合があります。
単に調剤スキルだけでなく、病院に対する経営的な視点を養うことができます。将来、独立して自分の薬局を開業したいと考えている人にとっては、学びに満ちたおもしろい職場だといえるでしょう。

ママ薬剤師歓迎！
クリニック薬剤師の転職はこちら
（エムスリーキャリア）

確認

薬剤師がクリニックで働くデメリット

次に、クリニックで働くデメリットについてみてみましょう。個人経営のクリニックには小規模ならではの問題もあります。

院長との相性の占める割合が大きい

クリニックは院長自身が経営していることがほとんどで、良くも悪くも「院長の個人商店」です。そのため、院長との関係性が働きやすさに大きく影響します。

院長の経営方針や性格に合えばストレスなく働けますが、院長との相性が悪いと逃げ場がなく、つらい思いを感じることになるかもしれません。個人経営のクリニックでは院長との関係は絶対的な上下関係ですし、大きな組織のように配置転換の可能性はないので、働きやすさにおいて人間関係の占める割合は大きくなります。

組織が小さいのでキャリアが広がりにくい

クリニックの場合、役職は管理薬剤師のみでそれ以上の昇進ポストはないので、同じ職場でキャリアアップすることは原則としてありません。

また、同じ診療科に関わるとはいえ、専門性を深めるというよりも、ルーティンワークを長く続ける働き方になりやすい傾向があります。他の診療科や症例に関わることがないので、長く働いてもキャリアの広がりには欠けます。いざ転職したいと考えたときに、経験不足を感じてしまうかもしれません。

一人薬剤師の場合、責任が重い

クリニックに薬剤師が1人しかいない場合、薬に関しては自分の判断がすべてです。疑義照会や監査を一人で行うプレッシャーがあります。また、調剤業務だけでなく、在庫管理、医薬品情報の管理などを単独で担うことに関しても、責任の重さを感じることになります。

自分が休むと業務が止まってしまうため、休みが取りづらいという面もあります。

新着のクリニック求人はこちら
クリニック薬剤師の転職はこちら
（エムスリーキャリア）

確認

クリニック勤務薬剤師が年収を上げるには

先ほどみたようにクリニック勤務の薬剤師の年収は数字上では高い傾向にありますが、院長の親族などでない場合は、給与はそこまで高くないのが実情かもしれません。では、現状の年収に満足できない場合、どのようにすればいいのでしょうか。

クリニックの科目に合わせた専門資格でサポート

クリニックでは、診療科目に関連する専門知識を持つ薬剤師が評価されやすいといえます。
たとえば糖尿病や在宅医療に関わる資格などを取り、専門的な勉強を続けていけば、院長を支える大きな力となることができます。「このクリニックに欠かせない薬剤師」と評価してもらえれば、待遇改善や給与アップにつながる可能性があります。

年収の高いところに転職する

ただ、個人経営のクリニックの場合、スタッフの給与に当てられる金額は決まっているので、長く働いたとしても給与アップは難しいかもしれません。個人的な関わりであるぶん、給与の金額のことを交渉しにくい面もあるでしょう。

もし、現在のクリニックの給与に不満がある場合は、希望をかなえるために交渉するよりも、給与の高いクリニックや調剤薬局、ドラッグストアなどに転職するほうが現実的な対処法です。
クリニックでの経験があれば、調剤薬局やドラッグストアでも問題なく働くことができるでしょう。

未経験者もご相談ください
クリニック薬剤師の転職はこちら
（エムスリーキャリア）

確認

まとめ

クリニック勤務は、勤務時間が安定していることと地域に密着した働き方が魅力だといえます。気になる年収は、クリニックによって大きく異なるのが実情です。

院長と相性がよく、条件面でも満足できるクリニックならば非常に働きやすく魅力的な職場です。一方で、キャリアの広がりや専門性の面ではもの足りなさを感じるかもしれません。
この記事を参考に、自分に合った勤務先について考えてみてはいかがでしょうか。